La existencia de este nuevo Juzgado no implicaría la desaparición de los Juzgados de Vigilancia Penitenciaria que existen en todas las provincias, que mantendrían sus competencias para los presos implicados en delitos que no pertenecen a la Audiencia Nacional.
El Gobierno espera tener lista en las próximas semanas la propuesta de reforma, que afectará a las leyes de Enjuiciamiento Criminal y Vigilancia Penitenciaria, a fin de que pueda ser tramitada y aprobada antes de que acabe el año.
José María Michavila aseguró que esta medida es acorde con la especialización de la Audiencia en la instrucción y enjuiciamiento de delitos de terrorismo, narcotráfico y crimen organizado, por lo cual el Juez de Vigilancia se ocuparía de presos terroristas, narcotraficantes y delincuentes condenados por este Tribunal.