El Real Decreto 680/2002, de 26 de julio, suprime la Secretaría de Estado de Economía, de la Energía y de la Pequeña y Mediana Empresa y crea la Secretaría de Estado de Economía y la Secretaría de Estado de Energía, Desarrollo Industrial y de la Pequeña y Mediana Empresa por lo que debe dotarse a este Departamento de una organización básica.
Ahora, el Real Decreto 777/2002 establece una organización y estructura básica del Ministerio de Economía acorde con las nuevas Secretarías de Estado citadas anteriormente.
El Real Decreto mantiene la Dirección General de Política Económica y suprime la Dirección General de Políticas Sectoriales, cuyas competencias se asumen por la nueva Dirección General.
En la Secretaría de Estado de Energía, Desarrollo Industrial y Pymes el Real Decreto 777/2002 mantiene las Direcciones Generales de Política Energética y Pymes, y crea la de Desarrollo industrial e Incentivos Regionales para centralizar toda la política de desarrollo sectorial.
Por otra parte, la Comisión del Mercado de las Telecomunicaciones pasa a depender orgánicamente del Ministerio de Ciencia y Tecnología, sin perjuicio de la dependencia funcional del Ministerio de Economía en las competencias que le son propias.
Finalmente, el Instituto para la Diversificación y Ahorro de la Energía se adscribe a la Secretaría de Estado de Energía, Desarrollo Industrial y Pymes del Ministerio de Economía.